После очередного обновления появились щелчки в динамиках.

В новых ядрах включен режим powersaving. От этого и щелчки (просыпание). Проверить можно:

$ cat /sys/module/snd_hda_intel/parameters/power_save

если 1, то оно включено.

Чтобы отключить, отредактировать /etc/modprobe.d/alsa-base.conf добавив строку:

options snd_hda_intel power_save=0

и перезагрузка.