После обновления и перезагрузки сервера заметил, что в roundcub новое письмо создается без адреса отправителя, соответственно профиль пользователя пуст. За эту информацию отвечает таблица identities. Зайдя через phpmyadmin в БД roundcubemail обнаружил, что повреждена таблица identities. Бэкап БД есть, включая эту таблицу.

Создаю таблицу:

CREATE TABLE `identities` (
`identity_id` int(10) unsigned NOT NULL AUTO_INCREMENT,
`user_id` int(10) unsigned NOT NULL,
`changed` datetime NOT NULL DEFAULT '1000-01-01 00:00:00',
`del` tinyint(1) NOT NULL DEFAULT '0',
`standard` tinyint(1) NOT NULL DEFAULT '0',
`name` varchar(128) NOT NULL,
`organization` varchar(128) NOT NULL DEFAULT '',
`email` varchar(128) NOT NULL,
`reply-to` varchar(128) NOT NULL DEFAULT '',
`bcc` varchar(128) NOT NULL DEFAULT '',
`signature` longtext,
`html_signature` tinyint(1) NOT NULL DEFAULT '0',
PRIMARY KEY (`identity_id`),
KEY `user_identities_index` (`user_id`,`del`),
KEY `email_identities_index` (`email`,`del`),
CONSTRAINT `user_id_fk_identities` FOREIGN KEY (`user_id`) REFERENCES `users` (`user_id`) ON DELETE CASCADE ON UPDATE CASCADE
) ENGINE=InnoDB AUTO_INCREMENT=147 DEFAULT CHARSET=utf8;
/*!40101 SET character_set_client = @saved_cs_client */;

Выбираю из бэкапа БД нужную таблицу скриптом:

# sed -n -e '/CREATE TABLE.*`identities`/,/CREATE TABLE/p' 2021-03-27.mail_roundcube.sql > identities.dump

где identities имя таблицы в бэкапе 2021-03-27.mail_roundcube.sql и запись данных в файл identities.dump.

НО! При операции ресторе, через phpmyadmin возникала ошибка, что логично.

Поэтому, почистил identities.dump от CREATE TABLE, DROP TABLE отставив только информацию между строками:

LOCK TABLES `identities` WRITE;
/*!40000 ALTER TABLE `identities` DISABLE KEYS */;
INSERT INTO `identities` VALUES (1,1,'2017-12-19 06:43:36',0,1,'acc','','acc@localhost','','',NULL,0),(2,2,'2017-12-19 06:44:09',0,1,'user','','user@lo...................................
/*!40000 ALTER TABLE `identities` ENABLE KEYS */;
UNLOCK TABLES;

Затем через phpmyadmin выбрав БД и таблицу делаю Импорт файла identities.dump. Все.