Рассмотрим ещё один способ аутентификации, не вводя каждый раз пароль. Отличие этого способа состоит в том, что мы не используем ключи, а пароли будут храниться в открытом виде на вашем компьютере.

Будем использовать ярлыки. Интерфейс командной строки к PuTTY имеет следующий вид:

putty.exe -load SESSION -pw PASSWORD

или же

putty.exe USER@SERVER -pw PASSWORD

Можно не указывать загрузку сеанса:

putty.exe -pw PASSWORD

или же не указывать пароль:

putty.exe -load SESSION

Тогда в первом случае, будет предложено выбрать необходимый сеанс, а во втором случае будет запрошен только пароль.

https://putty.org.ru/articles/putty-ssh-autologin.html