Понадобилось в FileZilla редактировать текстовые файлы в notepad, который установлен под Wine.

Смотрим какие есть вообще ассоциации:

$ mimeopen -d file.txt
Please choose a default application for files of type text/plain

1) notepad (wine-extension-txt)
2) LibreOffice Writer (libreoffice-writer)
3) Text Editor (xed)
4) Vim (vim)
5) Other...

Блокнот установлен. Далее нужно в окошке FileZilla — Редактирование — Настройки — Правка файлов — Ассоциации файлов написать:

inc /usr/bin/wine C:\\windows\\system32\\notepad.exe

и применить. Теперь при вызове из FileZilla текстовых файлов будет открываться блокнот или любое другое приложение прописанное там.