В samba v.4 пользовательские данные хранятся в файлах

/var/lib/samba/private/passdb.tdb
/var/lib/samba/private/secrets.tdb

При переносе также не забыть скопировать и системных пользователей:

/etc/passwd
/etc/shadow

Делаем ???:

# pdbedit -i